Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LPCAT2Q7L5N7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LPCAT2Q7L5N7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT2Q7L5N7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPCAT2Q7L5N7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms