Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BRINP3Q76B58 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BRINP3Q76B58 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
BRINP3Q76B58 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
BRINP3Q76B58 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BRINP3Q76B58 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BRINP3Q76B58 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BRINP3Q76B58 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BRINP3Q76B58 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BRINP3Q76B58 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BRINP3Q76B58 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BRINP3Q76B58 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BRINP3Q76B58 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
BRINP3Q76B58 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
BRINP3Q76B58 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BRINP3Q76B58 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms