Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRNIPQ6NTE8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRNIPQ6NTE8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRNIPQ6NTE8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms