Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC70Q6NSX1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC70Q6NSX1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms