Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXDC1Q5TGL8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PXDC1Q5TGL8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PXDC1Q5TGL8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PXDC1Q5TGL8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms