Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC93Q567U6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC93Q567U6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC93Q567U6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC93Q567U6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC93Q567U6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms