Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM30BQ3MIR4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM30BQ3MIR4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM30BQ3MIR4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms