Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHL40Q2TBA0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHL40Q2TBA0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHL40Q2TBA0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms