Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC142Q17RM4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC142Q17RM4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
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