Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNCBQ16143 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNCBQ16143 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNCBQ16143 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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