Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RYR3Q15413 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RYR3Q15413 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RYR3Q15413 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RYR3Q15413 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RYR3Q15413 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RYR3Q15413 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RYR3Q15413 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RYR3Q15413 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RYR3Q15413 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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