Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
R3HDM1Q15032 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
R3HDM1Q15032 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
R3HDM1Q15032 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
R3HDM1Q15032 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
R3HDM1Q15032 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
R3HDM1Q15032 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
R3HDM1Q15032 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
R3HDM1Q15032 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
R3HDM1Q15032 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
R3HDM1Q15032 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
R3HDM1Q15032 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
R3HDM1Q15032 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
R3HDM1Q15032 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
R3HDM1Q15032 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
R3HDM1Q15032 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
R3HDM1Q15032 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
R3HDM1Q15032 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
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