Protein–RNA interactions for Protein: Q13976

PRKG1, cGMP-dependent protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKG1Q13976 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKG1Q13976 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKG1Q13976 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKG1Q13976 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKG1Q13976 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKG1Q13976 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKG1Q13976 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKG1Q13976 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKG1Q13976 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKG1Q13976 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKG1Q13976 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKG1Q13976 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKG1Q13976 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKG1Q13976 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRKG1Q13976 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKG1Q13976 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKG1Q13976 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKG1Q13976 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms