Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf61Q13536 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf61Q13536 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf61Q13536 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
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