Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM32Q13049 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
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TRIM32Q13049 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
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TRIM32Q13049 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
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TRIM32Q13049 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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TRIM32Q13049 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
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TRIM32Q13049 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM32Q13049 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM32Q13049 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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