Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSPB3Q12988 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPB3Q12988 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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