Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NUP160Q12769 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
NUP160Q12769 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NUP160Q12769 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NUP160Q12769 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
NUP160Q12769 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
NUP160Q12769 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
NUP160Q12769 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
NUP160Q12769 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
NUP160Q12769 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
NUP160Q12769 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
NUP160Q12769 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
NUP160Q12769 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
NUP160Q12769 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
NUP160Q12769 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NUP160Q12769 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
NUP160Q12769 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
NUP160Q12769 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
NUP160Q12769 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
NUP160Q12769 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
NUP160Q12769 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
NUP160Q12769 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
NUP160Q12769 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
NUP160Q12769 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
NUP160Q12769 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NUP160Q12769 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
NUP160Q12769 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
NUP160Q12769 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NUP160Q12769 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
NUP160Q12769 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
NUP160Q12769 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
NUP160Q12769 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
NUP160Q12769 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NUP160Q12769 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NUP160Q12769 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
NUP160Q12769 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NUP160Q12769 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NUP160Q12769 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NUP160Q12769 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.22■■■■■ 4.03
NUP160Q12769 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NUP160Q12769 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
NUP160Q12769 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
NUP160Q12769 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
NUP160Q12769 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
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