Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
HMGXB3Q12766 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
HMGXB3Q12766 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
HMGXB3Q12766 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
HMGXB3Q12766 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
HMGXB3Q12766 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.41■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC44.4■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.7
HMGXB3Q12766 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC44.38■■■■■ 4.69
HMGXB3Q12766 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
HMGXB3Q12766 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
HMGXB3Q12766 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
HMGXB3Q12766 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
HMGXB3Q12766 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
HMGXB3Q12766 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
HMGXB3Q12766 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
HMGXB3Q12766 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
HMGXB3Q12766 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC44.33■■■■■ 4.69
HMGXB3Q12766 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
HMGXB3Q12766 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
HMGXB3Q12766 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC44.33■■■■■ 4.69
HMGXB3Q12766 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
HMGXB3Q12766 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
HMGXB3Q12766 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
HMGXB3Q12766 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
HMGXB3Q12766 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
HMGXB3Q12766 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
HMGXB3Q12766 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
HMGXB3Q12766 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
HMGXB3Q12766 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
HMGXB3Q12766 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
HMGXB3Q12766 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
HMGXB3Q12766 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
HMGXB3Q12766 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
HMGXB3Q12766 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
HMGXB3Q12766 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC44.24■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC44.22■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
HMGXB3Q12766 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
HMGXB3Q12766 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
HMGXB3Q12766 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
HMGXB3Q12766 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
HMGXB3Q12766 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
HMGXB3Q12766 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
HMGXB3Q12766 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
HMGXB3Q12766 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
HMGXB3Q12766 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
HMGXB3Q12766 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
HMGXB3Q12766 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
HMGXB3Q12766 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms