Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SMAGPQ0VAQ4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMAGPQ0VAQ4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms