Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP1-1Q07627 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRTAP1-1Q07627 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP1-1Q07627 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms