Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PSME1Q06323 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PSME1Q06323 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PSME1Q06323 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
PSME1Q06323 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PSME1Q06323 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PSME1Q06323 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PSME1Q06323 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PSME1Q06323 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PSME1Q06323 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PSME1Q06323 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PSME1Q06323 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PSME1Q06323 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PSME1Q06323 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PSME1Q06323 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
PSME1Q06323 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PSME1Q06323 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PSME1Q06323 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PSME1Q06323 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PSME1Q06323 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PSME1Q06323 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PSME1Q06323 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PSME1Q06323 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PSME1Q06323 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PSME1Q06323 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
PSME1Q06323 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PSME1Q06323 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PSME1Q06323 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PSME1Q06323 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms