Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPTBN1Q01082 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTBN1Q01082 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTBN1Q01082 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTBN1Q01082 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.1 ms