Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHC1P78364 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHC1P78364 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHC1P78364 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHC1P78364 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC1P78364 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC1P78364 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC1P78364 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC1P78364 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC1P78364 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC1P78364 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC1P78364 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC1P78364 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC1P78364 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC1P78364 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC1P78364 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC1P78364 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC1P78364 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHC1P78364 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHC1P78364 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHC1P78364 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHC1P78364 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHC1P78364 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHC1P78364 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHC1P78364 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHC1P78364 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC1P78364 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC1P78364 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC1P78364 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC1P78364 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHC1P78364 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHC1P78364 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHC1P78364 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHC1P78364 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHC1P78364 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHC1P78364 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC1P78364 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC1P78364 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC1P78364 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC1P78364 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC1P78364 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC1P78364 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC1P78364 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC1P78364 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC1P78364 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC1P78364 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHC1P78364 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHC1P78364 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHC1P78364 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHC1P78364 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHC1P78364 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHC1P78364 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHC1P78364 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC1P78364 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC1P78364 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC1P78364 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC1P78364 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC1P78364 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC1P78364 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC1P78364 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC1P78364 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC1P78364 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC1P78364 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHC1P78364 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHC1P78364 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHC1P78364 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHC1P78364 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHC1P78364 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHC1P78364 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHC1P78364 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHC1P78364 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHC1P78364 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHC1P78364 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHC1P78364 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHC1P78364 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PHC1P78364 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHC1P78364 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC1P78364 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC1P78364 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC1P78364 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC1P78364 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC1P78364 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC1P78364 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC1P78364 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHC1P78364 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHC1P78364 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHC1P78364 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHC1P78364 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHC1P78364 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHC1P78364 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHC1P78364 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHC1P78364 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHC1P78364 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHC1P78364 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHC1P78364 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHC1P78364 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHC1P78364 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHC1P78364 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PHC1P78364 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHC1P78364 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.1 ms