Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
VEGFBP49765 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VEGFBP49765 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VEGFBP49765 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFBP49765 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VEGFBP49765 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms