Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ETV4P43268 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ETV4P43268 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ETV4P43268 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ETV4P43268 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ETV4P43268 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ETV4P43268 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ETV4P43268 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ETV4P43268 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ETV4P43268 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ETV4P43268 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ETV4P43268 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ETV4P43268 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ETV4P43268 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ETV4P43268 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ETV4P43268 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ETV4P43268 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ETV4P43268 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ETV4P43268 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ETV4P43268 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETV4P43268 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETV4P43268 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETV4P43268 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETV4P43268 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ETV4P43268 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ETV4P43268 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ETV4P43268 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ETV4P43268 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETV4P43268 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETV4P43268 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETV4P43268 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETV4P43268 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETV4P43268 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETV4P43268 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETV4P43268 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETV4P43268 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ETV4P43268 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETV4P43268 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETV4P43268 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETV4P43268 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ETV4P43268 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETV4P43268 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETV4P43268 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ETV4P43268 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETV4P43268 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETV4P43268 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ETV4P43268 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ETV4P43268 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETV4P43268 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ETV4P43268 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETV4P43268 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETV4P43268 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETV4P43268 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETV4P43268 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ETV4P43268 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETV4P43268 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ETV4P43268 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ETV4P43268 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ETV4P43268 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ETV4P43268 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ETV4P43268 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETV4P43268 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETV4P43268 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETV4P43268 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ETV4P43268 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV4P43268 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV4P43268 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV4P43268 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV4P43268 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV4P43268 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV4P43268 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV4P43268 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV4P43268 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV4P43268 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV4P43268 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV4P43268 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV4P43268 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV4P43268 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ETV4P43268 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ETV4P43268 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ETV4P43268 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ETV4P43268 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ETV4P43268 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ETV4P43268 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV4P43268 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV4P43268 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV4P43268 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV4P43268 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV4P43268 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV4P43268 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV4P43268 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ETV4P43268 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ETV4P43268 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ETV4P43268 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ETV4P43268 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ETV4P43268 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ETV4P43268 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ETV4P43268 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ETV4P43268 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ETV4P43268 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms