Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTHFRP42898 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTHFRP42898 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MTHFRP42898 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTHFRP42898 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms