Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.81■■■■□ 3
USP6P35125 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
USP6P35125 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
USP6P35125 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
USP6P35125 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.79■■■■□ 3
USP6P35125 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP6P35125 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
USP6P35125 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP6P35125 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP6P35125 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.79■■■■□ 3
USP6P35125 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
USP6P35125 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
USP6P35125 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
USP6P35125 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
USP6P35125 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
USP6P35125 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
USP6P35125 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
USP6P35125 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
USP6P35125 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
USP6P35125 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP6P35125 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP6P35125 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP6P35125 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP6P35125 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP6P35125 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP6P35125 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP6P35125 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
USP6P35125 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
USP6P35125 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP6P35125 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP6P35125 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP6P35125 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP6P35125 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP6P35125 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP6P35125 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP6P35125 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP6P35125 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP6P35125 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP6P35125 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP6P35125 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP6P35125 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP6P35125 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
USP6P35125 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP6P35125 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP6P35125 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP6P35125 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP6P35125 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP6P35125 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP6P35125 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP6P35125 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP6P35125 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
USP6P35125 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
USP6P35125 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
USP6P35125 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP6P35125 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP6P35125 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP6P35125 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP6P35125 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP6P35125 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP6P35125 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP6P35125 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP6P35125 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP6P35125 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP6P35125 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP6P35125 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP6P35125 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP6P35125 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP6P35125 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP6P35125 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP6P35125 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP6P35125 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP6P35125 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP6P35125 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP6P35125 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP6P35125 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP6P35125 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP6P35125 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
USP6P35125 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
USP6P35125 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP6P35125 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP6P35125 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
USP6P35125 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP6P35125 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP6P35125 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP6P35125 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP6P35125 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP6P35125 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP6P35125 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP6P35125 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP6P35125 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP6P35125 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
USP6P35125 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
USP6P35125 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP6P35125 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP6P35125 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP6P35125 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP6P35125 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP6P35125 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP6P35125 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP6P35125 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms