Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLA-DMAP28067 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-DMAP28067 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DMAP28067 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DMAP28067 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1366.6 ms