Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CRYBB3P26998 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRYBB3P26998 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRYBB3P26998 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms