Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GADD45AP24522 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GADD45AP24522 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GADD45AP24522 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms