Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPL17P18621 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL17P18621 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL17P18621 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL17P18621 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL17P18621 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL17P18621 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPL17P18621 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL17P18621 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RPL17P18621 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL17P18621 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL17P18621 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL17P18621 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPL17P18621 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL17P18621 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL17P18621 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL17P18621 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL17P18621 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL17P18621 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPL17P18621 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL17P18621 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL17P18621 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL17P18621 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPL17P18621 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPL17P18621 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPL17P18621 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPL17P18621 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPL17P18621 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPL17P18621 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL17P18621 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL17P18621 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL17P18621 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL17P18621 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL17P18621 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL17P18621 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL17P18621 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL17P18621 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPL17P18621 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL17P18621 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL17P18621 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL17P18621 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL17P18621 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL17P18621 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPL17P18621 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL17P18621 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL17P18621 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL17P18621 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPL17P18621 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL17P18621 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL17P18621 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL17P18621 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL17P18621 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPL17P18621 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL17P18621 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL17P18621 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPL17P18621 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL17P18621 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL17P18621 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL17P18621 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL17P18621 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL17P18621 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL17P18621 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL17P18621 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RPL17P18621 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPL17P18621 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPL17P18621 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPL17P18621 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL17P18621 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL17P18621 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL17P18621 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL17P18621 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPL17P18621 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL17P18621 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL17P18621 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL17P18621 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPL17P18621 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL17P18621 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL17P18621 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL17P18621 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RPL17P18621 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL17P18621 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL17P18621 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL17P18621 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL17P18621 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL17P18621 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPL17P18621 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL17P18621 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL17P18621 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL17P18621 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL17P18621 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL17P18621 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL17P18621 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPL17P18621 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPL17P18621 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL17P18621 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL17P18621 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL17P18621 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL17P18621 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL17P18621 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RPL17P18621 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms