Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT7P08729 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT7P08729 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT7P08729 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT7P08729 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT7P08729 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT7P08729 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT7P08729 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT7P08729 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT7P08729 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT7P08729 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT7P08729 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT7P08729 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT7P08729 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT7P08729 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT7P08729 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT7P08729 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT7P08729 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT7P08729 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT7P08729 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT7P08729 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT7P08729 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT7P08729 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT7P08729 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT7P08729 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT7P08729 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT7P08729 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT7P08729 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT7P08729 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT7P08729 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT7P08729 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT7P08729 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT7P08729 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT7P08729 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT7P08729 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT7P08729 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT7P08729 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT7P08729 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT7P08729 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT7P08729 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT7P08729 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT7P08729 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT7P08729 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT7P08729 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT7P08729 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT7P08729 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT7P08729 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT7P08729 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT7P08729 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT7P08729 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT7P08729 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT7P08729 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT7P08729 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT7P08729 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT7P08729 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT7P08729 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT7P08729 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT7P08729 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT7P08729 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT7P08729 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT7P08729 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT7P08729 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT7P08729 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT7P08729 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT7P08729 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT7P08729 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT7P08729 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT7P08729 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT7P08729 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT7P08729 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT7P08729 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT7P08729 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT7P08729 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT7P08729 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT7P08729 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT7P08729 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT7P08729 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT7P08729 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT7P08729 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT7P08729 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT7P08729 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT7P08729 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT7P08729 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT7P08729 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT7P08729 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT7P08729 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT7P08729 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT7P08729 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT7P08729 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT7P08729 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT7P08729 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT7P08729 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT7P08729 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT7P08729 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT7P08729 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT7P08729 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT7P08729 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT7P08729 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT7P08729 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT7P08729 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms