Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP3A4P08684 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CYP3A4P08684 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYP3A4P08684 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYP3A4P08684 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms