Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LCA5LO95447 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LCA5LO95447 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCA5LO95447 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms