Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH16O75452 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDH16O75452 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDH16O75452 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDH16O75452 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDH16O75452 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RDH16O75452 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDH16O75452 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDH16O75452 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RDH16O75452 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDH16O75452 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDH16O75452 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDH16O75452 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDH16O75452 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDH16O75452 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDH16O75452 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDH16O75452 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDH16O75452 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDH16O75452 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDH16O75452 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDH16O75452 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RDH16O75452 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDH16O75452 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDH16O75452 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDH16O75452 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH16O75452 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH16O75452 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH16O75452 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH16O75452 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH16O75452 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH16O75452 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH16O75452 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH16O75452 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH16O75452 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH16O75452 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH16O75452 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH16O75452 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RDH16O75452 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RDH16O75452 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RDH16O75452 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDH16O75452 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDH16O75452 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDH16O75452 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDH16O75452 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RDH16O75452 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDH16O75452 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDH16O75452 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDH16O75452 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDH16O75452 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDH16O75452 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDH16O75452 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RDH16O75452 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDH16O75452 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDH16O75452 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDH16O75452 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RDH16O75452 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDH16O75452 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDH16O75452 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDH16O75452 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RDH16O75452 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RDH16O75452 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RDH16O75452 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RDH16O75452 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDH16O75452 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDH16O75452 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RDH16O75452 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDH16O75452 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDH16O75452 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDH16O75452 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDH16O75452 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RDH16O75452 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDH16O75452 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDH16O75452 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDH16O75452 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDH16O75452 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RDH16O75452 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDH16O75452 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDH16O75452 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDH16O75452 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDH16O75452 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDH16O75452 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDH16O75452 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RDH16O75452 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDH16O75452 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDH16O75452 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RDH16O75452 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDH16O75452 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDH16O75452 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDH16O75452 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RDH16O75452 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDH16O75452 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDH16O75452 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDH16O75452 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDH16O75452 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDH16O75452 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDH16O75452 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDH16O75452 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDH16O75452 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDH16O75452 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDH16O75452 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms