Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKNO60260 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKNO60260 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKNO60260 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKNO60260 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKNO60260 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKNO60260 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKNO60260 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKNO60260 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKNO60260 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKNO60260 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKNO60260 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKNO60260 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKNO60260 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKNO60260 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKNO60260 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKNO60260 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKNO60260 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKNO60260 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKNO60260 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKNO60260 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKNO60260 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKNO60260 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKNO60260 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKNO60260 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKNO60260 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKNO60260 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKNO60260 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKNO60260 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKNO60260 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKNO60260 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKNO60260 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKNO60260 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKNO60260 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKNO60260 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKNO60260 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKNO60260 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKNO60260 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKNO60260 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKNO60260 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKNO60260 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKNO60260 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKNO60260 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKNO60260 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKNO60260 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKNO60260 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKNO60260 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKNO60260 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKNO60260 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKNO60260 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKNO60260 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKNO60260 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKNO60260 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKNO60260 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKNO60260 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKNO60260 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKNO60260 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKNO60260 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKNO60260 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKNO60260 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKNO60260 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKNO60260 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKNO60260 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKNO60260 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKNO60260 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKNO60260 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKNO60260 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKNO60260 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKNO60260 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKNO60260 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKNO60260 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKNO60260 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKNO60260 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKNO60260 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKNO60260 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKNO60260 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKNO60260 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKNO60260 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKNO60260 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKNO60260 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKNO60260 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKNO60260 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKNO60260 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKNO60260 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKNO60260 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKNO60260 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKNO60260 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKNO60260 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKNO60260 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKNO60260 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKNO60260 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKNO60260 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKNO60260 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKNO60260 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKNO60260 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKNO60260 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKNO60260 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKNO60260 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKNO60260 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKNO60260 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms