Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC3O15379 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC3O15379 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC3O15379 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC3O15379 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms