Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NFKBIEO00221 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
NFKBIEO00221 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NFKBIEO00221 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NFKBIEO00221 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms