Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms