Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TARSL2A2RTX5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TARSL2A2RTX5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TARSL2A2RTX5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TARSL2A2RTX5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TARSL2A2RTX5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TARSL2A2RTX5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TARSL2A2RTX5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TARSL2A2RTX5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TARSL2A2RTX5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TARSL2A2RTX5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms