Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCE3A1L190 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCE3A1L190 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SYCE3A1L190 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYCE3A1L190 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCE3A1L190 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms