Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM223A0PJW6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM223A0PJW6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM223A0PJW6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM223A0PJW6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM223A0PJW6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM223A0PJW6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM223A0PJW6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM223A0PJW6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM223A0PJW6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM223A0PJW6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM223A0PJW6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM223A0PJW6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM223A0PJW6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms