Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SF3A1-203ENST00000444440 777 ntTSL 512.03□□□□□ -0.483e-6■□□□□ 8.8
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PCBP1Q15365 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.86e-6■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.826e-6■□□□□ 8.7
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PCBP1Q15365 RPL29-201ENST00000294189 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 RPL29-206ENST00000481629 880 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.691e-6■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 RPL29-205ENST00000480306 719 ntTSL 29.92□□□□□ -0.821e-6■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 RPL29-207ENST00000486565 574 ntTSL 1 (best)7.87□□□□□ -1.151e-6■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 TUBA1C-208ENST00000552125 575 ntTSL 412.09□□□□□ -0.476e-20■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 TUBA1C-206ENST00000549818 536 ntTSL 410.51□□□□□ -0.736e-20■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 TUBA1C-204ENST00000549183 696 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.86e-20■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-202ENST00000460563 1045 ntTSL 511.97□□□□□ -0.491e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-204ENST00000464888 565 ntTSL 211.66□□□□□ -0.541e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-203ENST00000463817 853 ntTSL 29.52□□□□□ -0.891e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-208ENST00000479815 1030 ntTSL 59.52□□□□□ -0.891e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-206ENST00000467700 932 ntTSL 28.35□□□□□ -1.071e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.121e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-207ENST00000468388 320 ntTSL 37.71□□□□□ -1.181e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.281e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 NONO-202ENST00000373841 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.43e-9■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 NONO-215ENST00000535149 2882 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.713e-9■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 NONO-201ENST00000276079 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.773e-9■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 NONO-214ENST00000490044 3215 ntTSL 28.04□□□□□ -1.123e-9■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 NONO-210ENST00000472185 397 ntTSL 57.38□□□□□ -1.233e-9■□□□□ 8.7
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