Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCSO14618 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCSO14618 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCSO14618 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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