Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms