Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 MIR6880-201ENST00000622851 62 ntBASIC11.23□□□□□ -0.618e-14■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 FKBP8-203ENST00000594844 593 ntTSL 423.47■■□□□ 1.357e-15■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.333e-7■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 FKBP8-207ENST00000597547 574 ntTSL 318.63■□□□□ 0.577e-15■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 NSMF-210ENST00000484316 933 ntTSL 318.43■□□□□ 0.543e-7■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 NSMF-202ENST00000371468 672 ntTSL 218.21■□□□□ 0.513e-7■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 PLOD2-208ENST00000480704 550 ntTSL 417.01■□□□□ 0.313e-7■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.263e-7■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 FKBP8-210ENST00000599540 1140 ntTSL 214.69□□□□□ -0.067e-15■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.223e-7■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 BRD3-206ENST00000494743 507 ntTSL 313.23□□□□□ -0.293e-7■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.333e-7■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.473e-7■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 NSMF-209ENST00000482448 551 ntTSL 312.13□□□□□ -0.473e-7■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 PLOD2-205ENST00000469350 723 ntTSL 59.15□□□□□ -0.943e-7■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RACK1-204ENST00000502890 705 ntTSL 311.23□□□□□ -0.615e-9■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.513e-27■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL30-203ENST00000517489 631 ntTSL 217■□□□□ 0.313e-27■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL30-211ENST00000521726 1129 ntTSL 316.83■□□□□ 0.283e-27■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL30-206ENST00000518850 614 ntTSL 216.02■□□□□ 0.163e-27■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL30-207ENST00000520998 747 ntTSL 216.02■□□□□ 0.163e-27■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL30-208ENST00000521112 573 ntTSL 1 (best)14.76□□□□□ -0.053e-27■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL30-201ENST00000287038 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.273e-27■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL30-205ENST00000518164 1128 ntTSL 1 (best)13.23□□□□□ -0.293e-27■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.293e-27■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RPL30-209ENST00000521291 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.613e-27■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.383e-10■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 YY1-203ENST00000554371 636 ntTSL 327.45■■□□□ 1.986e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-207ENST00000547283 555 ntTSL 423.12■■□□□ 1.296e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-222ENST00000550996 718 ntTSL 223.12■■□□□ 1.296e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-226ENST00000551430 751 ntTSL 323.12■■□□□ 1.296e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.196e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 AC073896.1-203ENST00000548360 512 ntTSL 421.56■■□□□ 1.046e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 PILRB-204ENST00000438028 1822 ntTSL 1 (best)21.32■■□□□ 16e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 16e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 16e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.976e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.936e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.936e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 PILRB-206ENST00000443526 1364 ntTSL 1 (best)20.53■□□□□ 0.886e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.32■□□□□ 0.846e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 PILRB-202ENST00000422808 1599 ntTSL 1 (best)20.21■□□□□ 0.836e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 AC073896.1-202ENST00000547423 566 ntTSL 419.92■□□□□ 0.786e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-219ENST00000550655 589 ntTSL 219.68■□□□□ 0.746e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.76e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 PILRB-201ENST00000419749 1506 ntTSL 1 (best)19.39■□□□□ 0.696e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-214ENST00000548849 1028 ntTSL 318.92■□□□□ 0.626e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 VAMP4-204ENST00000482519 586 ntTSL 318.34■□□□□ 0.536e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.526e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 PILRB-210ENST00000457519 2074 ntTSL 1 (best)18.26■□□□□ 0.516e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-227ENST00000551441 636 ntTSL 317.84■□□□□ 0.456e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.376e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 OBSCN-208ENST00000493977 732 ntTSL 317.27■□□□□ 0.366e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.236e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.26e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 PILRB-209ENST00000455145 902 ntTSL 515.76■□□□□ 0.116e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 VAMP4-203ENST00000474047 1738 ntTSL 1 (best)15.75■□□□□ 0.116e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.086e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 FBRS-206ENST00000494101 2782 ntTSL 215.15■□□□□ 0.026e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-230ENST00000551968 542 ntTSL 415.14■□□□□ 0.016e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-231ENST00000552222 555 ntTSL 414.99□□□□□ -0.016e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.046e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.066e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.226e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 PILRB-211ENST00000493091 4345 ntTSL 213.62□□□□□ -0.236e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.246e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 GABRE-202ENST00000417300 619 ntTSL 212.89□□□□□ -0.356e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.356e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-221ENST00000550734 747 ntTSL 512.83□□□□□ -0.366e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-223ENST00000551137 903 ntTSL 312.83□□□□□ -0.366e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.426e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 ASAP1-215ENST00000524299 550 ntTSL 411.72□□□□□ -0.536e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-218ENST00000550159 646 ntTSL 510.63□□□□□ -0.716e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-217ENST00000550044 546 ntTSL 410.58□□□□□ -0.726e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 EWSR1-211ENST00000437155 933 ntTSL 510.31□□□□□ -0.766e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-220ENST00000550700 559 ntTSL 410.31□□□□□ -0.766e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 29.78□□□□□ -0.846e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-211ENST00000548041 561 ntTSL 49.49□□□□□ -0.896e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 SF3A1-210ENST00000498259 875 ntTSL 29.25□□□□□ -0.936e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-206ENST00000546930 568 ntTSL 49.06□□□□□ -0.966e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-216ENST00000549221 553 ntTSL 48.88□□□□□ -0.996e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.086e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 EWSR1-214ENST00000455726 710 ntTSL 38.11□□□□□ -1.116e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 ASAP1-212ENST00000521426 566 ntTSL 48.03□□□□□ -1.126e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 CS-233ENST00000552688 580 ntTSL 47.68□□□□□ -1.186e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 STT3A-213ENST00000531001 325 ntTSL 37.35□□□□□ -1.236e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 ASAP1-209ENST00000520927 742 ntTSL 56.35□□□□□ -1.396e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 STT3A-202ENST00000524639 582 ntTSL 26.24□□□□□ -1.416e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 ASAP1-211ENST00000521075 5406 ntTSL 1 (best)6.17□□□□□ -1.426e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 STT3A-208ENST00000526726 582 ntTSL 35.24□□□□□ -1.576e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 OGT-211ENST00000498566 601 ntTSL 35.23□□□□□ -1.576e-13■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 EWSR1-209ENST00000415761 587 ntTSL 33.49□□□□□ -1.856e-6■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 ALDOA-208ENST00000562679 906 ntTSL 515.94■□□□□ 0.143e-27■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 ALDOA-220ENST00000566846 512 ntTSL 213.06□□□□□ -0.326e-27■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 ALDOA-214ENST00000564688 613 ntTSL 512.69□□□□□ -0.383e-27■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 ALDOA-210ENST00000563987 586 ntTSL 212.1□□□□□ -0.476e-27■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 ALDOA-205ENST00000562168 666 ntTSL 311.24□□□□□ -0.616e-27■□□□□ 9.5
PCBP1Q15365 LAMB2-219ENST00000542580 594 ntTSL 217.83■□□□□ 0.442e-6■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.079e-18■□□□□ 9.4
PCBP1Q15365 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.189e-18■□□□□ 9.4
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