RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.36■■■■■ 5.81
CS-222ENST00000550996 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.67■■■■■ 4.9
CS-222ENST00000550996 ABCC9O60706 1549 aa45.08■■■■■ 4.81
CS-222ENST00000550996 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.14■■■■■ 4.5
CS-222ENST00000550996 NACADO15069 1562 aa43.04■■■■■ 4.48
CS-222ENST00000550996 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.98■■■■■ 4.47
CS-222ENST00000550996 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
CS-222ENST00000550996 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.71■■■■■ 4.43
CS-222ENST00000550996 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.45■■■■■ 4.39
CS-222ENST00000550996 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.16■■■■■ 4.34
CS-222ENST00000550996 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.12■■■■■ 4.33
CS-222ENST00000550996 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.97■■■■■ 4.31
CS-222ENST00000550996 SCRIBQ14160 1630 aa41.74■■■■■ 4.27
CS-222ENST00000550996 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.73■■■■■ 4.27
CS-222ENST00000550996 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.38■■■■■ 4.21
CS-222ENST00000550996 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
CS-222ENST00000550996 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.72■■■■■ 4.11
CS-222ENST00000550996 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.51■■■■■ 4.08
CS-222ENST00000550996 SMARCA4P51532 1647 aa39.88■■■■□ 3.97
CS-222ENST00000550996 NCAPD3P42695 1498 aa39.78■■■■□ 3.96
CS-222ENST00000550996 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.78■■■■□ 3.96
CS-222ENST00000550996 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
CS-222ENST00000550996 SMARCA2P51531 1590 aa39.64■■■■□ 3.94
CS-222ENST00000550996 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.62■■■■□ 3.93
CS-222ENST00000550996 HMGXB3Q12766 1538 aa39.52■■■■□ 3.92
CS-222ENST00000550996 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.5■■■■□ 3.91
CS-222ENST00000550996 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
CS-222ENST00000550996 WIZO95785 1651 aa39.13■■■■□ 3.85
CS-222ENST00000550996 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
CS-222ENST00000550996 NESP48681 1621 aa38.96■■■■□ 3.83
CS-222ENST00000550996 ERCC6Q03468 1493 aa38.8■■■■□ 3.8
CS-222ENST00000550996 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.7■■■■□ 3.79
CS-222ENST00000550996 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
CS-222ENST00000550996 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.61■■■■□ 3.77
CS-222ENST00000550996 CUX2O14529 1486 aa38.49■■■■□ 3.75
CS-222ENST00000550996 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.46■■■■□ 3.75
CS-222ENST00000550996 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.39■■■■□ 3.74
CS-222ENST00000550996 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.38■■■■□ 3.73
CS-222ENST00000550996 CFTRP13569 1480 aa38.33■■■■□ 3.73
CS-222ENST00000550996 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.28■■■■□ 3.72
CS-222ENST00000550996 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.16■■■■□ 3.7
CS-222ENST00000550996 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.13■■■■□ 3.69
CS-222ENST00000550996 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.1■■■■□ 3.69
CS-222ENST00000550996 WDR62O43379 1518 aa38.02■■■■□ 3.68
CS-222ENST00000550996 PRDM2Q13029 1718 aa37.85■■■■□ 3.65
CS-222ENST00000550996 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
CS-222ENST00000550996 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
CS-222ENST00000550996 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.69■■■■□ 3.62
CS-222ENST00000550996 TOPBP1Q92547 1522 aa37.53■■■■□ 3.6
CS-222ENST00000550996 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.42■■■■□ 3.58
CS-222ENST00000550996 ABCC8Q09428 1581 aa37.4■■■■□ 3.58
CS-222ENST00000550996 IFT140Q96RY7 1462 aa37.33■■■■□ 3.57
CS-222ENST00000550996 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
CS-222ENST00000550996 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
CS-222ENST00000550996 CUX1P39880 1505 aa37.18■■■■□ 3.54
CS-222ENST00000550996 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
CS-222ENST00000550996 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.07■■■■□ 3.53
CS-222ENST00000550996 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.07■■■■□ 3.52
CS-222ENST00000550996 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
CS-222ENST00000550996 SOGA1O94964 1423 aa37.02■■■■□ 3.52
CS-222ENST00000550996 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.01■■■■□ 3.512e-12■■■■□ 26.6
CS-222ENST00000550996 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
CS-222ENST00000550996 OSCARQ8IYS5 282 aa36.85■■■■□ 3.49
CS-222ENST00000550996 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.79■■■■□ 3.48
CS-222ENST00000550996 SYNJ1O43426 1573 aa36.75■■■■□ 3.47
CS-222ENST00000550996 WDR97A6NE52 1622 aa36.73■■■■□ 3.47
CS-222ENST00000550996 TOP2BQ02880 1626 aa36.72■■■■□ 3.47
CS-222ENST00000550996 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.7■■■■□ 3.47
CS-222ENST00000550996 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.69■■■■□ 3.46
CS-222ENST00000550996 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.63■■■■□ 3.45
CS-222ENST00000550996 GRIN2BQ13224 1484 aa36.61■■■■□ 3.45
CS-222ENST00000550996 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.58■■■■□ 3.45
CS-222ENST00000550996 CHD1O14646 1710 aa36.56■■■■□ 3.44
CS-222ENST00000550996 FBLN2P98095 1184 aa36.55■■■■□ 3.44
CS-222ENST00000550996 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.55■■■■□ 3.44
CS-222ENST00000550996 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
CS-222ENST00000550996 PBRM1Q86U86 1689 aa36.45■■■■□ 3.43
CS-222ENST00000550996 SYNJ2O15056 1496 aa36.4■■■■□ 3.42
CS-222ENST00000550996 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
CS-222ENST00000550996 TRIM41Q8WV44 630 aa36.32■■■■□ 3.4
CS-222ENST00000550996 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.31■■■■□ 3.4
CS-222ENST00000550996 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.31■■■■□ 3.4
CS-222ENST00000550996 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.31■■■■□ 3.4
CS-222ENST00000550996 ARHGEF11O15085 1522 aa36.3■■■■□ 3.4
CS-222ENST00000550996 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.25■■■■□ 3.39
CS-222ENST00000550996 ADAMTS12P58397 1594 aa36.23■■■■□ 3.39
CS-222ENST00000550996 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.2■■■■□ 3.39
CS-222ENST00000550996 GRIN2AQ12879 1464 aa36.16■■■■□ 3.38
CS-222ENST00000550996 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.15■■■■□ 3.38
CS-222ENST00000550996 ARAP1Q96P48 1450 aa36.04■■■■□ 3.36
CS-222ENST00000550996 NUP160Q12769 1436 aa36.03■■■■□ 3.36
CS-222ENST00000550996 KIF27Q86VH2 1401 aa36.02■■■■□ 3.36
CS-222ENST00000550996 CEP170Q5SW79 1584 aa36.01■■■■□ 3.35
CS-222ENST00000550996 IGF1RP08069 1367 aa35.99■■■■□ 3.35
CS-222ENST00000550996 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.98■■■■□ 3.35
CS-222ENST00000550996 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.78■■■■□ 3.32
CS-222ENST00000550996 CUL7Q14999 1698 aa35.77■■■■□ 3.32
CS-222ENST00000550996 SHROOM2Q13796 1616 aa35.75■■■■□ 3.31
CS-222ENST00000550996 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.73■■■■□ 3.31
CS-222ENST00000550996 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.72■■■■□ 3.31
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