RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.37■■□□□ 1.17
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CS-218ENST00000550159 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa17.35■□□□□ 0.37
CS-218ENST00000550159 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa17.35■□□□□ 0.37
CS-218ENST00000550159 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.31■□□□□ 0.36
CS-218ENST00000550159 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.3■□□□□ 0.36
CS-218ENST00000550159 ARHGEF11O15085 1522 aa17.25■□□□□ 0.35
CS-218ENST00000550159 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.24■□□□□ 0.35
CS-218ENST00000550159 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.23■□□□□ 0.35
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CS-218ENST00000550159 TOPBP1Q92547 1522 aa16.8■□□□□ 0.28
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CS-218ENST00000550159 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-218ENST00000550159 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CS-218ENST00000550159 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.61■□□□□ 0.25
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CS-218ENST00000550159 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.6■□□□□ 0.25
CS-218ENST00000550159 SYNJ1O43426 1573 aa16.6■□□□□ 0.25
CS-218ENST00000550159 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
CS-218ENST00000550159 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.58■□□□□ 0.24
CS-218ENST00000550159 SOGA1O94964 1423 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-218ENST00000550159 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CS-218ENST00000550159 SYNJ2O15056 1496 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-218ENST00000550159 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-218ENST00000550159 GRIN2BQ13224 1484 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-218ENST00000550159 WDR97A6NE52 1622 aa16.39■□□□□ 0.21
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CS-218ENST00000550159 CEP170Q5SW79 1584 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-218ENST00000550159 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.25■□□□□ 0.19
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CS-218ENST00000550159 KDM6BO15054 1643 aa16.19■□□□□ 0.18
CS-218ENST00000550159 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
CS-218ENST00000550159 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CS-218ENST00000550159 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.14■□□□□ 0.17
CS-218ENST00000550159 SHROOM2Q13796 1616 aa16.13■□□□□ 0.17
CS-218ENST00000550159 JPH4Q96JJ6 628 aa16.13■□□□□ 0.17
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