Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC24CP53992 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms