Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM33Q9UPN9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM33Q9UPN9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM33Q9UPN9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM33Q9UPN9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM33Q9UPN9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms